莒南县境内地势东高西低，东部为低山丘陵区，西部为平原区，平均海拔200米，境内最高点为北部的马鬐山，海拔662.2米。有323条河流，年平均水资源总量4.4亿立方米。分西南、东南两大水系，河流总长1708公里。有大型水库1座，中型水库3座，小型水库199座，湿地面积达到3.5万亩，水资源比较丰富。

莒南县境内矿产资源比较丰富，种类较多，但总体来说储量较小，分布零散，开发利用以建筑石材为主。县内从历史上就有采矿活动，到目前为止，共发现矿产30种，金属和非金属矿产都有产出，其中探明储量的有9种，包括金属矿产：金、铁、钛3种；非金属矿产：花岗岩、白云石大理岩、重晶石、明矾石、沸石5种；水气矿产：地下水1种。已发现但无探明储量或仅有简测资料的矿产有21种。我县矿产资源特征是：矿种较多，但资源配套程序较差，能源矿产仅有一处煤矿点，金属矿产品种较少，规模小；非金属矿产种类较多，特别是化工用矿产和建材矿产，分布广、储量大、易采选。